Cet adjectif est essentiellemment employé dans les domaines techniques ou scientifiques.
Et il qualifie ce qui n’est pas intuitif ; ce qui va à l’encontre de l’intuition première, innée et automatique.
Avoir un jugement contre-intuitif nécessite de ne pas écouter ses sentiments mais de raisonner de façon intelligible et réfléchie.
Vous trouverez de nombreux exemples de phénomènes contre-intuitifs dans cet article : http://prof.math.free.fr/afficher.php?id=92
Sources : wiktionary.org, www.linternaute.fr et gdt.oqlf.gouv.qc.ca