Cette formule s'utilise couramment pour dire qu'une situation conflictuelle a été résolue et qu'il n’y a pas lieu d’y revenir.
On l'entend notamment en milieu scolaire par exemple, dans la bouche d'un CPE (Conseiller Principal d'Éducation) après une interruption de cours ou une altercation entre élèves lors d'une récréation.
On dit par exemple : "Allons, les enfants : c'est bon, l'incident est clos !".
Source : wiktionary.org