Ce substantif féminin relève du registre soutenu.
Et il désigne, selon le contexte :
- la tendance à faire le mal, à essayer de nuire en secret, en se servant des ressources de l'intelligence et de l'imaginatione ; la malveillance, la perfidie,
On dit par exemple : "Je me suis toujours méfié de la malignité de ce dirigeant".
- ou : le caractère dangereux et insidieux d'une affection et sa tendance à s'aggraver.
En particulier, le caractère cancéreux d'une tumeur.
On dit par exemple : "Il s'agit malheureusement d'un cancer dont la malignité est particulièrement redoutable".
Source : Le Robert, www.cnrtl.fr et www.larousse.fr