Cette locution verbale du registre familier ne s'applique absolument pas - au sens propre - au maçon qui construirait un mur...
Mais elle ne s'utilise pas pour autant au sens figuré, puisqu'elle tire son origine de la formule "Sauter par-dessus le mur", qui se disait - par ellipse - "Sauter le mur" jusqu'au début du XXe siècle.
"Faire le mur" signifie par conséquent : quitter un lieu sans autorisation, sortir d'un lieu clos lorsque cela est interdit, sortir d'une enceinte où l'on est consignné (caserne, école, prison, hôpital, etc.).
On dit par exemple : "J'ai fait le mur dimanche après-midi pour aller voir ma copine".
Sources : www.languefrancaise.net et wiktionary.org